MW proteína (sequência AA)

Massa molecular de proteína a partir da sequência

A massa molecular (MW) de uma proteína sai da soma das massas dos resíduos, descontando a água que cada ligação peptídica libera: MW = Σ MWaa − (n−1)·18,015 Da, com n sendo o número de resíduos e 18,015 Da a massa da água. Um atalho útil: o resíduo médio pesa cerca de 110 Da, o que coloca uma proteína de 100 aa perto de 11 kDa. Alguns exemplos deixam isso claro — insulina humana (51 aa) ≈ 5,8 kDa, albumina sérica (585 aa) ≈ 66 kDa, apolipoproteína B-100 (4 536 aa) ≈ 515 kDa. O ExPASy ProtParam é tratado como referência padrão; ele puxa massas média e monoisotópica da mesma tabela de resíduos.

Aplicações: bioinformática, biotec, espectrometria de massa

Calcular a MW a partir da sequência é trabalho do dia a dia na bioinformática (anotação UniProt, ProtParam), no design de proteínas e no desenvolvimento de vacinas, onde se lida com antígenos recombinantes e IgG terapêutica ≈ 150 kDa, e na espectrometria de massa, em que você compara a m/z observada com a MW prevista para fazer a identificação. Também orienta o planejamento do SDS-PAGE: escolhe-se a porcentagem de gel que resolve a banda esperada.

Perguntas frequentes

Por que a MW observada difere do valor previsto? Modificações pós-traducionais como glicosilação, fosforilação e clivagem de peptídeo sinal, somadas às pontes dissulfeto, deslocam a massa aparente para longe do cálculo cru.

Massa média ou monoisotópica? Fique com a média para SDS-PAGE e MS de baixa resolução, e troque para a monoisotópica quando passar para MS de alta resolução, como FT-ICR ou Orbitrap.

A fórmula por resíduo é precisa? Para o polipeptídeo não modificado ela fica dentro de 0,01% (erro < 0,01%), o que basta. Quando o número foge, a causa quase sempre é a biologia, não a conta.